Данный вопрос отражает имеющийся пробел в законодательстве. У акционера нет прямой обязанности сообщать акционерному обществу о том, что он стал единственным акционером.
В соответствии с Федеральным законом «О рынке ценных бумаг» и Федеральным законом «Об акционерных обществах» эмитенту (акционерному обществу) по его требованию предоставляется ограниченный перечень информации из реестра владельцев ценных бумаг, к которому НЕ относится информация об операциях по счетам акционеров.
Получается, что отслеживать движение акций (в том числе тех, которые учитываются на счете номинального держателя) общество может:
а) запрашивая с определенной периодичностью у регистратора списки владельцев ценных бумаг;
б) в результате уведомления акционером общества о начале корпоративного действия (преимущественное право, обязательное / добровольное предложение, принудительный выкуп акций).

Подтверждение принятия решения акционером, которому принадлежат все голосующие акции, не зависит от места учета прав на акции (на лицевом счете владельца или в депозитарии, которому открыт лицевой счет номинального держателя). Принятие решения единственным акционером публичного акционерного общества может быть подтверждено лицом, осуществляющим ведение реестра акционеров такого общества (регистратором); принятие решения единственным акционером непубличного акционерного общества – нотариусом или регистратором. Практическая реализация оказания услуги зависит от лица, оказывающего услугу (подтверждающего принятие решения нотариуса или регистратора).

Позиция Банка России (государственного регулятора, осуществляющего надзор за соблюдением корпоративного законодательства): к решениям единственного акционера НЕ применяются положения п.3 ст.67.1 ГК РФ, подтверждение принятия решения НЕ ТРЕБУЕТСЯ. Позиция судов, выраженная в том числе в определениях и обзорах практики Верховного суда Российской Федерации: к решениям единственного акционера ПРИМЕНЯЮТСЯ положения п.3 ст.67.1 ГК РФ, подтверждение принятия решения ТРЕБУЕТСЯ. Акционерное общество (его единственный акционер) самостоятельно, с учётом риск-ориентированного подхода, определяет, подтверждать принятие решений, в том числе об утверждении годовой отчетности, или нет.

Регистратор при направлении сведений в ФНС России руководствуется ч. 6.1 и ч. 7.1 ст. 4.1 Федерального закона «О развитии малого и среднего предпринимательства в Российской Федерации». Если акционерное общество соответствует указанным в федеральном законе условиям, то сведения могут быть направлены как с 1 по 5 июля текущего года, так и с 1 по 5 число соответствующего месяца. Однако, для акционерных обществ, созданных 1 декабря прошлого года или позднее, предусмотрен особый порядок включения в Единый реестр субъектов малого и среднего предпринимательства (МСП) – сведения вносятся в реестр 10 числа месяца, следующего за месяцем государственной регистрации общества, при условии, что единственным учредителем акционерного общества является физическое лицо или юридическое лицо – субъект МСП. Направление регистратором сведений в ФНС России не влияет на данный порядок включения акционерных обществ в реестр субъектов МСП.